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L'étude fut fortement critiquée par d'autres chercheurs en raison des risques d'erreur et des méthodes statistiques utilisées. Séralini et ses collègues avaient choisi une souche de rats qui est connue pour développer spontanément très rapidement des tumeurs cancéreuses - surtout en cas de suralimentation, de vieillissement ou de troubles de l'équilibre hormonal. Il n'a pas été publié quelle quantité de nourriture les rats ont exactement reçu. A aussi été critiqué l'art et la manière dont les auteurs informaient au préalable des journalistes sur l'étude. Ainsi des journalistes ont dû signer avant la publication de l'étude un Non Disclosure Agreement (un accord de non-divulgation):

L'étude fut fortement critiquée par d'autres chercheurs en raison des risques d'erreur et des méthodes statistiques utilisées. Séralini et ses collègues avaient choisi une souche de rats qui est connue pour développer spontanément très rapidement des tumeurs cancéreuses - surtout en cas de suralimentation, de vieillissement ou de troubles de l'équilibre hormonal. Il n'a pas été publié quelle quantité de nourriture les rats ont exactement reçu. A aussi été critiqué l'art et la manière dont les auteurs informaient au préalable des journalistes sur l'étude. Ainsi des journalistes ont dû signer avant la publication de l'étude un Non Disclosure Agreement (un accord de non-divulgation):

''"Un remboursement du coût de l'étude de plusieurs millions d'euros serait considéré comme des dommages et intérêts si la divulgation prématurée remettait en cause la publication de l'étude."'' Dans le Nouvel observateur, on apprend que ''Jusqu’en 2011, les chercheurs ont travaillé dans des conditions de quasi-clandestinité. Ils ont crypté leurs courriels comme au Pentagone, se sont interdit toute discussion téléphonique et ont même lancé une étude leurre tant ils craignaient un coup de Jarnac des multinationales de la semence.''

''"Un remboursement du coût de l'étude de plusieurs millions d'euros serait considéré comme des dommages et intérêts si la divulgation prématurée remettait en cause la publication de l'étude."'' Dans le Nouvel observateur, on apprend que jusqu’en 2011, les chercheurs ont crypté leurs courriels et se sont interdit toute discussion téléphonique par crainte des multinationales de la semence.

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